Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX WGA Kit單細胞全基因組擴增試劑盒
華雅思創(chuàng)生物現貨供應
【產品優(yōu)勢】
1.可再生的單個細胞的結果(或< 15 pg DNA)
2.優(yōu)越的再現性等位基因的表示
3.(RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒易于使用和自動化
4.(RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒在所有分辨率、微陣列和PCR上都有明確的結果
【產品應用】
研究領域
PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒的適用范圍十分廣泛,多種原始材料和微量樣品均可通過該試劑盒進行單細胞全基因組擴增,
•生物標志物研究(CNVs、SNVs)
•體外受精胚胎植入前基因測序
•轉基因動物基因分型
•胚胎和干細胞研究
•單精子分型 腫瘤
•體細胞遺傳變異分析
•腫瘤進化和發(fā)展
•腫瘤干細胞
•循環(huán)腫瘤細胞 細菌
•宏基因組學研究
•微生物基因分型
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒可實現高度均一的全基因組擴增,其核心技術為多次退火環(huán)狀循環(huán)擴增(MALBAC)技術,該技術利用獨特的具有鏈置換活性的DNA聚合酶進行準線性的全基因組預擴增,通過PCR進行指數式擴增,為下游分析提供充分的實驗材料。
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒解決了單細胞全基因組擴增的其中幾個必要的矛盾:
1. 線性擴增。如果用全基因組PCR擴增,因為PCR的擴增偏向性,再加上PCR過程中較小的偏向性通過指數放大,其結果就會是嚴重的覆蓋不均一,導致在許多地方只有很低的覆蓋、甚至沒有覆蓋。所以,保證模板被線性地擴增,是首要問題。
2. 全基因組覆蓋。常規(guī)的建庫方法,因為補平、加A、接頭連接效率的問題,起始DNA中有很大一部分會被浪費,沒有形成有效文庫分子(也就是兩頭都接好引物的DNA片段)。在單細胞測序中,這是不可接受的。
3. 高擴增效率。單細胞中的每個基因位置理論上都只有2個拷貝,而要從2個拷貝擴增到足夠建立文庫的DNA量,要經過許多次的擴增。這就需要很高的擴增效率。而一般的線性擴增很難有好的擴增效率
我們的PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒與MALBAC其技術原理一樣,
MALBAC™技術(Multiple Annealing and Looping Based Amplification Cycles),即多次退火環(huán)狀循環(huán)擴增技術,為一種單細胞全基因組擴增技術,先利用獨特的具有鏈置換活性的DNA聚合酶進行準線性的全基因組預擴增,再通過PCR技術進行指數式擴增,為下游分析提供充足的實驗材料。
MALBAC™技術源于哈佛大學,其專利全球唯一指定授權給億康基因,是目前世界上最先進的單細胞全基因組擴增技術,使用該技術的相關論文發(fā)表于頂級科學期刊《Cell》、《Science》、《PNAS》等。使用該技術,科學家們完成了迄今覆蓋度最高的單精子基因圖譜,首次對人類單個卵細胞完成了測序。Science雜志評選單細胞測序技術為2013年最具發(fā)展前景的六大科學項目之一,Nature Methods也將其選為Method of the Year 2013。
MALBAC技術優(yōu)勢:
1) MALBAC技術降低PCR擴增偏倚,使得單細胞中最大90%以上的基因組能夠被測序。
2) MALBAC技術使得檢測單細胞中較小的DNA序列變異變得更容易,因此能夠發(fā)現個別細胞之間的遺傳差異。這樣的差異可以幫助解釋癌癥惡化的機制,生殖細胞形成機制,甚至是個別神經元的差異機制。
3) 靈敏度高:單細胞、單染色體或0.5pg的基因組DNA即可進行擴增。
4) MALBAC技術擴增均勻性顯著優(yōu)于其它同類技術,低覆蓋度測序數據即可進行CNV分析,用于染色體三體檢測及染色體微缺失變異檢測。
5) 擴增產物用途廣泛:可用于二代測序、微陣列、qPCR、基因克隆等下游應用。
MALBAC™引領學術突破性進展:
1.在國際頂尖雜志發(fā)表文章:Science 、Cell 、PNAS、Annual Review等
2.嚴格驗證MALBAC技術用于PGS的文章發(fā)表于ASRM(美國生殖醫(yī)學學會)會刊
3.首次完成人類單個卵細胞的測序
4.完成迄今覆蓋度最高的單精子基因圖譜
5.全球首個無創(chuàng)植入前染色體篩查寶寶誕生,相關成果發(fā)表于《PNAS》
Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒其原理:
PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒通過擴增產物的末端自封閉來抑制指數擴增。 •
PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒通過數輪線性擴增得到大量的擴增產物
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【研究領域】
1. 外顯子組富集
2. SureSelect® 富集
3. SeqCap® EZ 富集
4. 福爾馬林固定石蠟包埋DNA測序
5. 胚胎植入前遺傳學篩查(PGS)/種植前遺傳學診斷(PGD)
6. DNA測序
7. RNA測序
8. 染色體免疫共沉淀測序
產品名稱 |
平臺 |
應用程序 |
樣本 |
樣本量 |
技術 |
ThruPLEX®DNA-seq Kit |
Illumina NGS |
WGS, WES, 靶向測序, 染色體免疫共沉淀測序, 轉錄組測序 |
FFPE DNA, gDNA, cDNA, |
50 pg – 50 ng |
高靈敏度基于連接的擴增 |
ThruPLEX®-FD Prep Kit |
Illumina NGS |
WGS, WES, 靶向測序,ctDNA分析 |
Cell-free DNA isolated from plasma |
<1 ng – 30 ng |
高靈敏度基于連接的擴增 |
PicoPLEX™ |
Illumina NGS |
CNV, |
Eukaryotic Cells |
<6 pg – 60pg |
準隨機引物線性擴增 |
PicoPLEX™ |
陣列, |
CNV, |
Eukaryotic Cells |
<6 pg – 60 pg DNA |
準隨機引物線性擴增 |
TransPLEX®C-WTA Kit |
陣列, |
基因表達分析 |
RNA |
10 – 300 ng RNA |
準隨機引物擴增 |
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